Культуральное исследование микромицетов из глубоководных донных отложений Адриатического моря
##plugins.themes.ibsscustom.article.main##
Google Scholar
##plugins.themes.ibsscustom.article.details##
Аннотация
Впервые выявлены таксономический состав и особенности структуры комплексов грибов с горизонтов до 30 см ниже границы вода — дно в глубоководных донных отложениях Адриатического моря. Керн донных отложений 0–30 см был взят 18.10.2007 с борта НИС Palagruža (Хорватия) с помощью колончатого пробоотборника подводного телеробота QUEST 4000 на глубине 1020 м в точке с координатами 41°43′13″N, 17°34′19″E. Пробу серого ила разрезали на 30 частей толщиной в 1 см. Грибы выделяли на агаризованные среды Чапека и Сабуро, по две повторности на каждой среде, в аэробных условиях, при температуре +18 °C, с добавлением 3%-ного спиртового раствора хлорамфеникола (1 мл·л−1 среды). Количество грибных колониеобразующих единиц (КОЕ) рассчитывали на 1 г сухого осадка. Обнаружили 16 таксонов; 12 определили до вида, 4 — до рода. Таксоны отнесены к 13 родам, 8 семействам, 7 порядкам, 5 классам отделов Ascomycota и Basidiomycota; также выделен стерильный мицелий. В горизонте осадка 0–1 см грибы не выявлены. Максимальная численность грибов составляла 4300 КОЕ·г−1 сухого осадка (горизонт 6–7 см). Максимальное количество таксонов, 6, обнаружено в горизонте 14–15 см. В этом исследовании к отделу Ascomycota относились 87,5 % видов. По литературным данным составлены списки видов грибов из подстилающих горизонтов осадков Атлантического, Индийского и Тихого океанов и Чёрного моря, на основании которых вычислены значения таксономических индексов Δ+ (average taxonomic distinctness index, AvTD) и Λ+ (variation in taxonomic distinctness index, VarTD) и построены их графики. Анализ показал общую структуру микобиот водоёмов, о чём свидетельствуют значения индексов, входящие в 95%-ную доверительную воронку. Близкие значения индексов обусловлены доминированием видов грибов из классов Dothideomycetes, Eurotiomycetes, Sordariomycetes и Saccharomycetes, составляющих от 73,13 % (Индийский океан) до 87,50 (Чёрное и Адриатическое моря) от видового состава.
Авторы
Библиографические ссылки
Билай В. И., Коваль Э. З. Аспергиллы : определитель. Киев : Наукова думка, 1988. 204 с. [Bilai V. I., Koval’ E. Z. Aspergilly : opredelitel’. Kyiv : Naukova dumka, 1988, 204 p. (in Russ.)]
Копытина Н. И., Бочарова Е. А., Гулина Л. В. Новые находки культивируемых микромицетов в глубоководных отложениях Чёрного моря // Труды Института биологии внутренних вод им. И. Д. Папанина РАН. 2024. № 105 (108). С. 45–53. [Kopytina N., Bocharova E., Gulina L. New findings of cultured micromycetes in the deep-sea sediments of the Black Sea. Trudy Instituta biologii vnutrennikh vod im. I. D. Papanina RAN, 2024, no. 105 (108), pp. 45–53. (in Russ.)]. https://doi.org/10.47021/0320-3557-2024-45-53
Кураков А. В., Лаврентьев Р. Б., Нечитайло Т. Ю., Голышин П. Н., Звягинцев Д. Г. Разнообразие факультативно-анаэробных мицелиальных микроскопических грибов в почвах // Микробиология. 2008. Т. 77, № 1. С. 103–112. [Kurakov A. V., Lavrent’ev R. B., Nechitailo T. Yu., Golyshin P. N., Zvyagintsev D. G. Diversity of facultatively anaerobic microscopic mycelial fungi in soils. Mikrobiologiya, 2008, vol. 77, no. 1, pp. 103–112. (in Russ.)]
Кураков А. В., Хидиров К. С., Садыкова В. С., Звягинцев Д. Г. Способность к анаэробному росту и активность спиртового брожения у микроскопических грибов // Прикладная биохимия и микробиология. 2011. Т. 47, № 2. С. 187–193. [Kurakov A. V., Khidirov K. S., Sadykova V. S., Zvyagintsev D. G. Anaerobic growth ability and alcohol fermentation activity of microscopic fungi. Prikladnaya biokhimiya i mikrobiologiya, 2011, vol. 47, no. 2, pp. 187–193. (in Russ.)]
Методы экспериментальной микологии : справочник. Киев : Наукова думка, 1982. 550 с. [Metody eksperimental’noi mikologii : spravochnik. Kyiv : Naukova dumka, 1982, 550 p. (in Russ.)]
Atlas of Clinical Fungi. 2nd ed. / G. S. de Hoog, J. Guarro, J. Gene, M. J. Figueras (Eds). Utrecht : Centraalbureau voor Schimmelcultures, 2000, 1126 p.
Barone G., Rastelli E., Corinaldesi C., Tangherlini M., Danovaro R., Dell’Anno A. Benthic deep-sea fungi in submarine canyons of the Mediterranean Sea. Progress in Oceanography, 2018, vol. 168, pp. 57–64. https://doi.org/10.1016/j.pocean.2018.09.011
Clarke K. R., Gorley R. N., Somerfield P. J., Warwick R. M. Change in Marine Communities: An Approach to Statistical Analysis and Interpretation. 3ʳᵈ ed. Plymouth : PRIMER-E, 2014, 260 p.
Damare S., Raghukumar C., Raghukumar S. Fungi in deep-sea sediments of the Central Indian Basin. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2006, vol. 53, iss. 1, pp. 14–27. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2005.09.005
Edgcomb V. P., Kysela D. T., Teske A., de Vera Gomez A., Sogin M. L. Benthic eukaryotic diversity in the Guaymas Basin hydrothermal vent environment. Proceedings of the National Academy of Sciences, 2002, vol. 99, no. 11, pp. 7658–7662. https://doi.org/10.1073/pnas.062186399
Florio Furno M., Poli A., Ferrero D., Tardelli F., Manzini C., Oliva M., Pretti C., Campani T., Casini S., Fossi M. C., Varese G. C., Prigione V. The culturable mycobiota of sediments and associated microplastics: From a harbor to a marine protected area, a comparative study. Journal of Fungi, 2022, vol. 8, iss. 9, art. no. 927 (18 p.). https://doi.org/10.3390/jof8090927
Index Fungorum / Royal Botanic Gardens, Kew : [site]. URL: https://www.kew.org/science [accessed: 23.04.2024].
Jebaraj C. S., Raghukumar C., Behnke A., Stoeck T. Fungal diversity in oxygen-depleted regions of the Arabian Sea revealed by targeted environmental sequencing combined with cultivation. FEMS Microbiology Ecology, 2010, vol. 71, iss. 3, pp. 399–412. https://doi.org/10.1111/j.1574-6941.2009.00804.x
Keeler E., Burgaud G., Teske A., Beaudoin D., Mehiri M., Dayras M., Cassand J., Edgcomb V. Deep-sea hydrothermal vent sediments reveal diverse fungi with antibacterial activities. FEMS Microbiology Ecology, 2021, vol. 97, iss. 8, art. no. fiab103 (20 p.). https://doi.org/10.1093/femsec/fiab103
Kiel Reese B., Sobol M. S., Bowles M. W., Hinrichs K.-U. Redefining the subsurface biosphere: Characterization of fungi isolated from energy-limited marine deep subsurface sediment. Frontiers in Fungal Biology, 2021, vol. 2, art. no. 727543 (19 p.). https://doi.org/10.3389/ffunb.2021.727543
Lipej L., Kovačić M., Dulčić J. An analysis of Adriatic ichthyofauna–ecology, zoogeography, and conservation status. Fishes, 2022, vol. 7, iss. 2, art. no. 58 (29 p.). https://doi.org/10.3390/fishes7020058
Muntañola-Cvetković M., Ristanović B. A mycological survey of the South Adriatic Sea. Journal of Experimental Marine Biology and Ecology, 1980, vol. 43, iss. 3, pp. 193–206. https://doi.org/10.1016/0022-0981(80)90047-7
Pachiadaki M. G., Rédou V., Beaudoin D. J., Burgaud G., Edgcomb V. P. Fungal and prokaryotic activities in the marine subsurface biosphere at Peru Margin and Canterbury Basin inferred from RNA-based analyses and microscopy. Frontiers in Microbiology, 2016, vol. 7, art. no. 846 (16 p.). https://doi.org/10.3389/fmicb.2016.00846
Raghukumar C., Damare S. R., Singh P. A review on deep-sea fungi: Occurrence, diversity and adaptations. Botanica Marina, 2010, vol. 53, no. 6, pp. 479–492. https://doi.org/10.1515/bot.2010.076
Raghukumar C., Raghukumar S. Barotolerance of fungi isolated from deep-sea sediments of the Indian Ocean. Aquatic Microbial Ecology, 1998, vol. 15, no. 2, pp. 153–163. https://doi.org/10.3354/ame015153
Ristanović B., Muntañola-Cvetković M., Munjko I. Phenoldegrading fungi from South Adriatic Sea and Lake Skadar. European Journal of Applied Microbiology and Biotechnology, 1975, vol. 1, iss. 4, pp. 313–322. https://doi.org/10.1007/BF01382690
Rojas-Jimenez K., Grossart H.-P., Cordes E., Cortés J. Fungal communities in sediments along a depth gradient in the Eastern Tropical Pacific. Frontiers in Microbiology, 2020, vol. 11, art. no. 575207 (9 p.). https://doi.org/10.3389/fmicb.2020.575207
Rédou V., Ciobanu M. C., Pachiadaki M. G., Edgcomb V., Alain K., Barbier G., Burgaud G. In-depth analyses of deep subsurface sediments using 454-pyrosequencing reveals a reservoir of buried fungal communities at record-breaking depths. FEMS Microbiology Ecology, 2014, vol. 90, iss. 3, pp. 908–921. https://doi.org/10.1111/1574-6941.12447
Rédou V., Navarri M., Meslet-Cladière L., Barbier G., Burgaud G. Species richness and adaptation of marine fungi from deep-subseafloor sediments. Applied and Environmental Microbiology, 2015, vol. 81, no. 10, pp. 3571–3583. https://doi.org/10.1128/AEM.04064-14
Vargas-Gastélum L., Riquelme M. The mycobiota of the deep sea: What omics can offer. Life, 2020, vol. 10, iss. 11, art. no. 292 (18 p.). https://doi.org/10.3390/life10110292
Wang Y. T., Xue Y. R., Liu C. H. A brief review of bioactive metabolites derived from deep-sea fungi. Marine Drugs, 2015, vol. 13, iss. 8, pp. 4594–4616. https://doi.org/10.3390/md13084594
Wang Z.-P., Liu Z.-Z., Wang Y.-L., Bi W.-H., Liu L., Wang H.-Y., Zheng Y., Zhang L.-L., Hu S.-G., Xu S.-S., Zhang P. Fungal community analysis in seawater of the Mariana Trench as estimated by Illumina HiSeq. RSC Advances, 2019, vol. 9, no. 12, pp. 6956–6964. https://doi.org/10.1039/c8ra10142f
Xu W., Gao Y., Gong L., Li M., Pang K.-L., Luo Z.-H. Fungal diversity in the deep-sea hadal sediments of the Yap Trench by cultivation and high throughput sequencing methods based on ITS rRNA gene. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2019, vol. 145, pp. 125–136. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2019.02.001
Xu W., Gong L., Pang K.-L., Luo Z.-H. Fungal diversity in deep-sea sediments of a hydrothermal vent system in the Southwest Indian Ridge. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2018, vol. 131, pp. 16–26. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2017.11.001
Xu W., Pang K.-L., Luo Z.-H. High fungal diversity and abundance recovered in the deep-sea sediments of the Pacific Ocean. Microbial Ecology, 2014, vol. 68, pp. 688–698. https://doi.org/10.1007/s00248-014-0448-8
Zaitsev Y. P., Polikarpov G. G. Recently discovered new biospheric pelocontour function in the Black Sea reductive bathyal zone. Journal of the Black Sea / Mediterranean Environment, 2008, vol. 14, no. 3, pp. 151–165.
Zhang T., Wang N. F., Zhang Y. Q., Liu H. Y., Yu L. Y. Diversity and distribution of fungal communities in the marine sediments of Kongsfjorden, Svalbard (High Arctic). Scientific Reports, 2015, vol. 5, art. no. 14524 (11 p.). https://doi.org/10.1038/srep14524
Zhang X., Tang G., Xu X., Nong X., Qi S.-H. Insights into deep-sea sediment fungal communities from the East Indian Ocean using targeted environmental sequencing combined with traditional cultivation. PLoS One, 2014, vol. 9, iss. 10, art. no. e109118 (11 p.). https://doi.org/10.1371/journal.pone.0109118
Zhang X.-Y., Wang G.-H., Xu X.-Y., Nong X.-H., Wang J., Amin M., Qi S.-H. Exploring fungal diversity in deep-sea sediments from Okinawa Trough using high-throughput Illumina sequencing. Deep Sea Research Part I: Oceanographic Research Papers, 2016, vol. 116, pp. 99–105. https://doi.org/10.1016/j.dsr.2016.08.004
Zhou Y., Gao X., Shi C., Li M., Jia W., Shao Z., Yan P. Diversity and antiaflatoxigenic activities of culturable filamentous fungi from deep-sea sediments of the South Atlantic Ocean. Mycobiology, 2021, vol. 49, iss. 2, pp. 151–160. https://doi.org/10.1080/12298093.2020.1871175
