Электронная коллекция паразитов рыб Мирового океана Института морских биологических исследований им. А. О. Ковалевского
##plugins.themes.bootstrap3.article.main##
Google Scholar
##plugins.themes.bootstrap3.article.details##
Аннотация
Биологические коллекции — основа для таксономических исследований и изучения биологического разнообразия регионов. Задача настоящей работы — создание электронного каталога коллекционных образцов и таксономической базы данных (БД), а также развитие веб-ресурса для доступа к ним с целью интегрирования биологических коллекций в исследовательский процесс. Коллекция паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН послужила материалом для создания сайта, который написан на PHP с использованием сценариев JavaScript и работает под управлением веб-сервера Apache. Управление БД осуществлено при помощи СУБД MySQL. Сайт marineparasites.org включает каталог коллекционных материалов, таксономическую базу данных и библиотеку публикаций о видах паразитов рыб. Интерфейс сайта обеспечивает доступ к перечисленным ресурсам. В основе функционирования сайта лежат четыре связанные друг с другом сущности: объект хранения, организмы, таксоны и публикации. Каждому понятию соответствует таблица базы данных. В процессе ввода система автоматически формирует связи между коллекционными экземплярами организмов, их типовым статусом и прочими атрибутами. Посетители сайта при помощи выборок и фильтров делают запросы и получают целостное представление о коллекции. Страница таксона состоит из данных о систематическом положении вида и его синонимах. На странице о виде-паразите расположен индикатор наличия экземпляров вида в коллекции, перечень атрибутов коллекционных экземпляров, публикации, где упоминается данный вид, типовой район и хозяин вида-паразита, а также другие места и хозяева находок, описания и изображения видов. Таким образом, пользователь планомерно переходит от описаний видов паразитов к их хозяевам, от коллекционных образцов — к изображениям и диагнозам видов, к публикациям и обратно. Сайт сделан англоязычным, что даёт возможность зарубежным и отечественным исследователям получить информацию о коллекции паразитов рыб Мирового океана ИМБИ РАН и интегрировать её в международные веб-ресурсы по биоразнообразию. Аудитория сайта — профессиональные исследователи паразитов, но заложенные идеи позволяют достроить сайт до виртуальной коллекции любых организмов или до веб-портала о разнообразии флоры и фауны любого региона. Сайт является результатом плодотворного взаимодействия биологов и программистов, способствует интенсификации обмена коллекционными данными и образцами и служит инструментом исследования паразитарной компоненты морских сообществ.
Авторы
Библиографические ссылки
Лях А. М., Лелеков С. Г., Токарев Ю. Н., Царин С. А. Таксономические информационные системы Института морских биологических исследований // Электронные информационные системы. 2016. № 1 (8). С. 53-62. [Lyakh A. M., Lelekov S. G., Tokarev Yu. N., Tsarin S. G. Taxonomic information systems of the Institute of Marine Biological Research. Elektronnye informatsionnye sistemy, 2016, no. 1 (8), pp. 53–62. (in Russ.)].
Bradley R. D., Bradley L. C., Garner H. J., Baker R. J. Assessing the value of natural history collections and addressing issues regarding long-term growth and care. BioScience, 2014, vol. 64, no. 12, pp. 1150–1158.
Communication of the European Commission to the Council and to the Parliament on a European Community Biodiversity Strategy. Available at: http://www.faunaeur.org/documents/ComBioDivStrat.pdf.
Gibson D., Bray R., Hunt D., Georgiev B., Scholz T., Harris P., Bakke T., Pojmanska T., Niewiadomska K., Kostadinova A., Tkach V., Bain O., Durette-Desset M., Gibbons L., Moravec F., Petter A., Dimitrova Z., Buchmann K., Valtonen E., de Jong Y. Fauna Europaea: Helminths (Animal Parasitic). Biodiversity Data Journal, 2014, no. 2, e1060, doi: 10.3897/BDJ.2.e1060.
Zinovieva S. V., Butorina N. N., Udalova Z. V., Khasanova O. S., Filimonova L. V., Petrosyan V. G., Pel’gunov A. N. World collections of parasitic worms. Biology Bulletin, 2015, vol. 42, no. 6, pp. 540–545.
